That he stole the pen is clear. The sentence is;

Subordinate/Dependent Clause

যে Clause নিজে নিজে পরিপূর্ণ অর্থ প্রকাশ করতে পারে না, অর্থ প্রকাশের জন্য Principal Clause-এর উপর নির্ভর করে তাকে Subordinate Clause/Dependent Clause বলে। Subordinate Clause সাধারণত একটি Subordinating Conjunction যেমন- when, while, before, after, till, until, who, which, whom, since, though, although, if, unless ইত্যাদি দিয়ে শুরু হয়।

Rahim said that he was good.

Classification of Subordinate Clause: 

1) Noun Clause 2) Adjective Clause 3) Adverbial Clause